Prada Open Lab Notebook

Lab notebook for Dr. Prada's lab working on Coral phylogeny. Worked on by Myles Wagner.

Notebook Website About and CV Other
browse by category or date or tag
admin

PsbA-NC PCR #9 8/14/19

E41 E42 E43 E44 E45 E46 E47 E48 E49 E50 E51 E52 E53 P15

Read More

PsbA-NC PCR #8 8/14/19

E27 E28 E29 E30 E31 E32 E33 E34 E35 E36 E37 E40 E54 P16

Read More

PsbA-NC PCR #7 8/14/19

E15 E16 E17 E18 E19 E20 E21 E22 E23 E24 E25 E26

Read More

PsbA-NC PCR #10 8/14/19

P1 P2 P3 P4 P5 P6 P7 P8 P9 P10 P11 P12 P13 P14

Read More

PsbA-NC PCR #6 8/13/19

Testing Diluting primers

Read More

CA6 PCR #9 8/13/19

E53 E54 P13 P14 P15 P16 E8 E9 E10 E11 E12 E13 E14

Read More

PsbA-NC PCR #5 8/12/19 - Temperature Gradient

E6 E7

Read More

CA6 PCR #8 8/12/19

P1 P2 P3 P4 P5 P6 P7 P8 P9 P10 P11 P12

Read More

CA6 PCR #7 8/12/19

E41 E42 E43 E44 E45 E46 E47 E48 E49 E50 E51 E52

Read More

CA6 PCR #6 8/12/19

E27 E28 E29 E30 E31 E32 E33 E34 E35 E36 E37 E40

Read More

CA6 PCR #5 8/12/19

E15 E16 E17 E18 E19 E20 E21 E22 E23 E24 E25 E26

Read More

Preparing samples for sequencing 8/7/19

E1 E2 E3 E4 E5 P1 P2 P3 P4 P5

Read More

Qubit 8/6/19

E1 E2 E3 E4 E5 P1 P2 P3 P4 P5

Read More

CA6 information

CA6

Read More

CA6 PCR #4 8/5/19 - Temperature Gradient

E7

Read More

PsbA-NC PCR #4 7/31/19

Testing a higher annealing temp

Read More

DNA Gel 7/31/19

Testing DNA samples

Read More

PsbA-NC PCR #3 7/30/19

Testing more cycles and higher annealing temp

Read More

PsbA-NC PCR #2 7/29/19

Testing other Primers - E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7

Read More

PsbA-NC PCR #1 7/29/19

E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 E8 E9 E10 E11 E12 E13 E14

Read More

PsbA-NC information

PsbA-NonCoding

Read More

Primer information

This is a sheet of info for all of the primers I have used

Read More

IA2 information

IA2

Read More

IA2 PCR #6 7/29/19

E53 E54 P13 P14 P15 P16 E18 E25 E31 E42 P2 P12

Read More

IA2 PCR #5 7/24/19

P1 P2 P3 P4 P5 P6 P7 P8 P9 P10 P11 P12

Read More

IA2 PCR #4 7/24/19

E41 E42 E43 E44 E45 E46 E47 E48 E49 E50 E51 E52

Read More

IA2 PCR #3 7/24/19

E27 E28 E29 E30 E31 E32 E33 E34 E35 E36 E37 E40

Read More

IA2 PCR #2 7/24/19

E15 E16 E17 E18 E19 E20 E21 E22 E23 E24 E25 E26

Read More

IA2 PCR #1 7/23/19

E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 E8 E9 E10 E11 E12 E13 E14

Read More

28S PCR #6 7/23/19

E53 E54 P13 P14 P15 P16 E46

Read More

28S information

28S

Read More

28S PCR #5 7/22/19

P1 P2 P3 P4 P5 P6 P7 P8 P9 P10 P11 P12

Read More

28S PCR #4 7/22/19

E41 E42 E43 E44 E45 E46 E47 E48 E49 E50 E51 E52

Read More

28S PCR #3 7/22/19

E27 E28 E29 E30 E31 E32 E33 E34 E35 E36 E37 E40

Read More

28S PCR #2 7/22/19

E15 E16 E17 E18 E19 E20 E21 E22 E23 E24 E25 E26

Read More

28S PCR #1 7/17/19

E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 E8 E9 E10 E11 E12 E13 E14

Read More

24F information

24F

Read More

24F PCR #6 7/16/19

E53 E54 P13 P14 P15 P16

Read More

24F PCR #5 7/16/19

P1 P2 P3 P4 P5 P6 P7 P8 P9 P10 P11 P12

Read More

24F PCR #4 7/16/19

E41 E42 E43 E44 E45 E46 E47 E48 E49 E50 E51 E52

Read More

24F PCR #3 7/16/19

E27 E28 E29 E30 E31 E32 E33 E34 E35 E36 E37 E40

Read More

24F PCR #2 7/16/19

E15 E16 E17 E18 E19 E20 E21 E22 E23 E24 E25 E26

Read More

24F PCR #1 7/15/19

E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 E8 E9 E10 E11 E12 E13 E14

Read More

CA6 PCR #3 7/15/19 - testing less cycles

E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 - test

Read More

CA6 PCR #2 7/10/19 - testing BAS

E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 - test

Read More

CA6 PCR #1 7/9/19

E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 E8 E9 E10 E11 E12 E13 E14

Read More

CA4 information

CA4

Read More

CA4 PCR #6 7/8/19

E53 E54 P13 P14 P15 P16 E4 E11 E25 E27 E30 E43

Read More

CA4 PCR #5 7/8/19

52°C annealing temp: E47 E48 E49 E50 E51 E52 P7 P8 P9 P10 P11 P12

Read More

CA4 PCR #4 7/8/19

51°C annealing temp: E41 E42 E43 E44 E45 E46 P1 P2 P3 P4 P5 P6

Read More

CA4 PCR #3 7/3/19

E27 E82 E29 E30 E31 E32 E33 E34 E35 E36 E37 E40

Read More

CA4 PCR #2 7/3/19

E15 E16 E17 E18 E19 E20 E21 E22 E23 E24 E25 E26

Read More

CA4 PCR #1 7/3/19

E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 E8 E9 E10 E11 E12 E13 E14

Read More

Learning to make Phylogentic trees

ND2 tree

Read More

ND2 sequences

ND2 sequences

Read More

Learning to make Phylogentic trees #2

COI tree

Read More

COI sequences

COI sequences

Read More

23S1M13 information

23S1M13

Read More

23S1M13 PCR #10 7/1/19

E4 E30 E34 E54 P2 P3

Read More

23S1M13 PCR #9 6/26/19

P2 P3 P11 P13 P14 P15

Read More

23S1M13 PCR #8 6/26/19

E4 E7 E8 E9 E10 E12 E18 E25 E30 E31 E43 E54

Read More

23S1M13 PCR #7 6/25/19

P7 P8 P9 P10 P11 P12 P13 P14 P15 P16 E52 E53 E54

Read More

23S1M13 PCR #6 6/25/19

E46 E47 E48 E49 E50 E51 P1 P2 P3 P4 P5 P6

Read More

23S1M13 PCR #5 6/25/19

E32 E33 E34 E35 E36 E37 E40 E41 E42 E43 E44 E45

Read More

23S1M13 PCR #4 6/25/19

E20 E21 E22 E23 E24 E25 E26 E27 E28 E29 E30 E31

Read More

23S1M13 PCR #3 6/25/19

E8 E9 E10 E11 E12 E13 E14 E15 E16 E17 E18 E19

Read More

23S1M13 PCR #2 6/24/19

E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7

Read More

23S1M13 PCR #1 6/24/19

E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 E8 E9 E10 E11 E12 E13 E14

Read More

ITS1 information

ITS1

Read More

ITS1 PCR #6 6/19/19

E53 E54 P13 P14 P15 P16 E4 E7 E34 E36 E37 P2

Read More

ITS1 PCR #5 6/19/19

P1 P2 P3 P4 P5 P6 P7 P8 P9 P10 P11 P12

Read More

ITS1 PCR #4 6/19/19

E41 E42 E43 E44 E45 E46 E47 E48 E49 E50 E51 E52

Read More

ITS1 PCR #3 6/18/19

E27 E28 E29 E30 E31 E32 E33 E34 E35 E36 E37 E40

Read More

ITS1 PCR #2 6/18/19

E15 E16 E17 E18 E19 E20 E21 E22 E23 E24 E25 E26

Read More

ITS1 PCR #1 6/18/19

E1 E2 E3 E4 E5 E6 E7 E8 E9 E10 E11 E12 E13 E14

Read More

B7Sym15 information

B7Sym15

Read More

B7Sym15 PCR 6/17/19

E9 E28 E30 E32 E35 E36 / E37 E44 E45 E53 P2 P14

Read More

ITS2 information

ITS2

Read More

ITS2 PCR 6/12/19

E16 E17 E19 E24 E30 E32 / E34 E35 E48 E52 E53 P15

Read More

B7Sym15 PCR 6/12/19

E30 E31 E32 E34 E35 E36 / E37 E43 E44 E45 E47 E53

Read More

B7Sym15 PCR 6/10/19 #2

E4 E7 E9 E11 E12 E16 / E17 E19 E24 E25 E27 E28

Read More

B7Sym15 PCR 6/10/19 #1

E1 E3 E51 E52 E53 E54 / E5 E6 P13 P14 P15 P16

Read More

B7Sym15 PCR 6/5/19 #4

P1 P2 P3 P3 P5 P6 / P7 P8 P9 P10 P11 P12

Read More

B7Sym15 PCR 6/5/19 #3

E37 E40 E41 E42 E43 E44 / E45 E46 E47 E48 E49 E50

Read More

B7Sym15 PCR 6/5/19 #2

E25 E26 E27 E28 E29 E30 / E31 E32 E33 E34 E35 E36

Read More

B7Sym15 PCR 6/5/19 #1

E13 E14 E15 E16 E17 E18 / E19 E20 E21 E22 E23 E24

Read More

B7Sym15 test #3 PCR 6/4/19 - Changing the time of the amplification

E1 E2 E3 E4 E5 E6

Read More

B7Sym15 PCR 6/4/19

E1 E2 E3 E4 E5 E6 / E7 E8 E9 E10 E11 E12

Read More

B7Sym15 test #4 PCR 6/4/19 - Adding cycles to the PCR

E1 E2 E3 E4 E5 E6

Read More

ITS2 PCR 6/3/19

E8 E9 E10 E16 E17 E19 E20 / E21 E24 E28 E30 E32 P14 P15

Read More

B7Sym15 test #2 PCR 6/3/19 - Adding more time to amplification

E1 E2 E3 E4 E5 E6

Read More

B7Sym15 test #1 PCR 6/3/19 - Adding extra DNA

E1 E2 E3 E4 E5 E6

Read More

DNA Extractions 5/29/19

E8 E9 E10 E16 E17 E19 E20 E21 E24 E28 E30 E32 P14 P15

Read More

ITS2 PCR 5/28/19 #2

P14 P15 E51 E52 E53 E54 / E34 E35 E36 E37 E43 E44

Read More

ITS2 PCR 5/28/19 #1

E37 E40 E41 E42 E43 E44 / E45 E46 E47 E48 E49 E50

Read More

B7Sym15 PCR 5/28/19

P2 P3 P7 P8 P9 P10 / P11 P12 P13 P14 P15 P16

Read More

B7Sym15 PCR 5/22/19

E13 E14 E15 E16 E17 E18 / P1 P2 P3 P4 P5 P6

Read More

ITS2 PCR 5/21/19

P2 P5 P6 P7 P8 P9 / P10 P11 P12 P13 P14 P15 P16

Read More

DNA Extractions 5/21/19

P2, P7

Read More

Starting Costal Fellowship 5/20/19

Test ITS2 PCR on: P1 P3 P4 E34 E35 E36

Read More

B7Sym15 PCR 4/29/19

E7 E8 E9 E10 E11 E12 (#2)

Read More

B7Sym15 PCR 4/26/19

E1 E2 E3 E4 E5 E6 (#2)

Read More

B7Sym15 PCR 4/22/19

E7 E8 E9 E10 E11 E12

Read More

B7Sym15 PCR 4/19/19

E1 E2 E3 E4 E5 E6

Read More

ITS2 PCR 4/15/19

E8 E9 E10 E16 E17 E19

Read More

ITS2 PCR 4/12/19

E20 E21 E24 E28 E30 E32

Read More

ITS2 PCR 4/5/19

E16 E17 E19 E20 E21 E24

Read More

Qubit 4/1/19

E8 E9 E10 E11 E12 E15 E16 E17

Read More

ITS2 PCR 4/1/19

E8 E9 E10 E11 E12 E15

Read More

ITS2 PCR 3/29/19

E15 E16 E17 E19 E20 E21

Read More

ITS2 PCR 3/25/19

E3 E4 E7 E9 E10 E11

Read More

ITS2 PCR 3/22/19

E28 E29 E30 E31 E32 E33

Read More

ITS2 PCR 3/18/19

E22 E23 E24 E25 E26 E27

Read More

ITS2 PCR 3/4/19

E15 E16 E17 E19 E20 E21

Read More

ITS2 PCR 3/1/19

E9 E10 E11 E12 E13 E14

Read More

ITS2 PCR 2/25/19

E2 E3 E4 E6 E7 E8

Read More

DNA Extractions 2/22/19

E26, E27, E28, E29, E30, E31, E32, E33

Read More

DNA Extractions 2/18/19

E19, E21, E22, E23, E24, E25

Read More

DNA Extractions 2/15/19

E12, E13, E14, E15, E16, E17

Read More

DNA Extractions 2/11/19

E6, E7, E8, E9, E10, E11

Read More

ITS2 PCR 2/8/19

E19 E29 E34 E35

Read More

ITS2 PCR 2/4/19

E8 E12 E15 E16 E17 E24

Read More

Starting ITS2 PCRs 2/1/19

E1 E5 E12 E18 E24

Read More

Learning Gel Molds

Gel Mold 1/28/19

Read More

DNA Extractions 1/25/19

E2, E3, E4

Read More

Learning DNA Extractions second day

Learning DNA extractions (2/2)

Read More

Learning DNA Extractions first day

Learning DNA extractions (1/2)

Read More

Day 1: Aliquoting Coral DNA extraction samples

Day 1

Read More